В 1594 г. в селе Игнатьево был построен новый храм. После освящения храмовая икона трижды исчезала. Ее находили в одном и том же месте, в лесу, за три версты от храма, «стоящей на воздухе». Священник с помощью прихожан, перенес храм на место чудесного явления иконы, и поселился сам.
В смутное время начала 17 века село Игнатьево сильно пострадало и обезлюдило, храм сохранился, однако запустел на тридцать лет. Его возродил преподобный Лукиан в 1640 году, который поселился здесь с несколькими братиями. Но через какое-то время монастырь был закрыт, братия изгнана. Потом открывался снова, снова изгонялась и так три раза.
Параллельно с Лукиановой пустыней, Лукиан по просьбе александровских купцов создал еще один монастырь, в Александрове, женский. Лукиан был для сестер пастырем и отцом. Так на его попечении оказалось два монастыря.
После смерти Лукиана продолжателем его духовных традиций стал преподобный Корнилий. Более 20-и лет подвизался он в устроении обителей. После смерти преподобные Лукиан и Корнелий были прославлены в лике местночтимых святых Владимирской епархии. С тех пор монастырь развивался мирно и без особых событий.
В начале 1920-х гг. монастырь был закрыт. Первым во Владимирской епархии. Иноки, покинули обитель. Все имущество поступило в музей, часть икон и святынь обители была поругана и уничтожена, а строения переданы соседнему племенному совхозу.
И первой из всей Владимирской епархии обитель была возрождена в 1991 году. Восстановление Богородице-Рождественской Свято-Лукиановой пустыни до сих пор не закончено и сопряжено с немалыми трудностями.
Обитель славится в области своим цветочно-ягодным питомником, в котором братия монастыря вместе с волонтерами разводят прекрасные розы и множество сортов ягодных кустарников и фруктовых деревьев.
